畜牧課	掌理畜牧試驗、育種改良、生產及動物診斷、禽畜引進馴化、育種繁殖、動物飼育，畜產試驗研究。
推廣課	掌理種畜及乳、畜產品之推廣、供銷，乳品加工、畜牧污染防治、農民輔導及推廣教育等事項。
總務課	掌理綜合業務、保險、出納、庶務、文書、印信、管考、營繕工程、財產管理及不屬各課之事項。
會計室	掌理會計、統計、歲計，預算編審及憑證審核，各項經費申請核發、財物購置、營繕工程之監標、監驗。